技術簡介

CUT&Tag（Cleavage Under Targets and Tagmentation）是蛋白質-DNA互作關系研究的新方法，是新一代超微量ChIP-Seq技術，適用于無ChIP級別抗體的蛋白研究。與傳統的ChIP-Seq研究方法相比，該技術無需交聯、超聲打斷、末端抹平和接頭連接等操作，因此具有省時高 效、所需的樣品量少、背景信號低和可重復性好等優點，甚至可用于單細胞水平測序。CUT&Tag有望將蛋白質-DNA互作的研究變成一種類似PCR反應的常規操作，對基因調控、表觀遺傳等領域的研究具有革命性的意義。

產品優勢

   樣品起始量低：能夠對及少量樣品進行分析

   無需ChIP級別抗體：無需提供ChIP級別抗體

   性價比高：背景噪音低，所需測序深度少

   實驗重復性好：實驗重復結果一致性好

技術原理

ChiTag是Protein A蛋白與Tn5轉座酶的融合蛋白，當抗體結合目的蛋白（如轉錄因子、組蛋白等）后，Protein A蛋白可直接結合抗體，攜帶的Tn5轉座酶可特異性的切割目的蛋白附近的DNA片段，并將DNA片段連上接頭，文庫構建之后可進行高通量測序。 

圖注：云序生物CUT&Tag實驗流程

樣本要求

1）樣品類型：細胞、組織，其它樣品信息請詳詢

2）樣品量

細胞：2×10⁶

組織：50mg

3）樣品保存：細胞樣品或新鮮組織塊，液氮凍存后，-80℃ 保存。

4）樣品運輸：干冰運輸。

案例解析

CUT&Tag技術研究蛋白質-DNA互作的優勢

原文：CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells

期刊：Nature Communications 發表時間：20190429 影響因子： 11.878

在生物學研究中，DNA與蛋白質之間的互作是至關重要的，參與基因的表達、調控、復制、重組和修復以及RNA的轉運、翻譯和調控等多個過程，幾乎涉及所有的生命活動。目前研究兩者互作的方法很多，作者選擇了傳統的研究手段ChIP-seq，優化的CUT&RUN方法，以及新方法CUT&Tag共同研究組蛋白H3K27me3。通過比對實驗結果，發現CUT&Tag有zui低的背景噪聲以及zui強的信號。通過對H3K4me1修飾物進行分析，顯示CUT&Tag的靈敏度zui高，實驗可重復性zui好。 

圖1. CUT&Tag方法的優點