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acRIP-seq的富集效率是決定數據質量的關鍵,云序生物acRIP-seq實驗采用預驗證的商業化抗體和精心優化的實驗流程,具有極高的效率和特異性。
分子全覆蓋
可全 面檢測mRNA、circRNA、LncRNA、pri-miRNA、rRNA、tRNA等多類RNA分子ac4C乙?;稽c。
可整合RNA乙?;瘮祿娃D錄組數據進行生物信息學關聯分析,揭示RNA乙?;瘜虮磉_調控的影響,深入挖掘RNA乙?;墓δ?。
案例解析美國ai癥研究所(NCI)和弗雷德里克實驗室,發現下調NAT10(RNA乙?;福┠軌蛞?制Hela細胞的行為;并且ac4C是由NTA10催化的mRNA修飾,下調NAT10后,ac4C的總體水平下降;為了進一步探究ac4C的功能,作者對WT和下調NAT10的Hela細胞進行acRIP-seq和mRNA測序,發現ac4C 的peak主要富集在mRNA的CDS區,同時下調NAT10能夠降低ac4C在mRNA中的定點表達,并與靶mRNA的下調有很大關系;作者又進一步發現ac4C乙?;揎椖軌蛲ㄟ^延長mRNA的半衰期并促進mRNA的穩定性,同時也能夠通過ac4C peak中的密碼子偏好性表達,決定并影響mRNA的解碼效率,促進底物翻譯。這些發現不僅擴大了mRNA修飾范圍(包括乙?;瘹埢?,也確立了ac4C在mRNA翻譯調控中的作用。
圖注:ac4C的結構及Ac4C peak在mRNA中的特征分布情況
圖注:ac4C延長mRNA的半衰期,提高其穩定性
acRIP-seq的富集效率是決定數據質量的關鍵,云序生物acRIP-seq實驗采用預驗證的商業化抗體和精心優化的實驗流程,具有極高的效率和特異性。
分子全覆蓋
可全 面檢測mRNA、circRNA、LncRNA、pri-miRNA、rRNA、tRNA等多類RNA分子ac4C乙?;稽c。
可整合RNA乙?;瘮祿娃D錄組數據進行生物信息學關聯分析,揭示RNA乙?;瘜虮磉_調控的影響,深入挖掘RNA乙?;墓δ?。
案例解析美國ai癥研究所(NCI)和弗雷德里克實驗室,發現下調NAT10(RNA乙?;福┠軌蛞?制Hela細胞的行為;并且ac4C是由NTA10催化的mRNA修飾,下調NAT10后,ac4C的總體水平下降;為了進一步探究ac4C的功能,作者對WT和下調NAT10的Hela細胞進行acRIP-seq和mRNA測序,發現ac4C 的peak主要富集在mRNA的CDS區,同時下調NAT10能夠降低ac4C在mRNA中的定點表達,并與靶mRNA的下調有很大關系;作者又進一步發現ac4C乙?;揎椖軌蛲ㄟ^延長mRNA的半衰期并促進mRNA的穩定性,同時也能夠通過ac4C peak中的密碼子偏好性表達,決定并影響mRNA的解碼效率,促進底物翻譯。這些發現不僅擴大了mRNA修飾范圍(包括乙?;瘹埢?,也確立了ac4C在mRNA翻譯調控中的作用。
圖注:ac4C的結構及Ac4C peak在mRNA中的特征分布情況
圖注:ac4C延長mRNA的半衰期,提高其穩定性
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