技術簡介
用體外轉錄法標記生物素RNA探針，然后與胞漿蛋白提取液孵育，形成RNA-蛋白質復合物。該復合物可與鏈霉親和素標記的磁珠結合，從而與孵育液中的其他成分分離。復合物洗脫后，通過Western Blot檢測特定的RNA結合蛋白是否與RNA相互作用，質譜實驗檢測特定的RNA結合蛋白鑒定蛋白質類型。

 云序RNA pull down實驗流程

云序優勢
低豐度富集：
富集檢測低豐度目的蛋白-RNA復合物
具有成熟蛋白質組學平臺：
提供RNApull-down 產物WesternBlot及質譜鑒定。
專業的生信信息分析：
提供SCI發表級別的圖表。

樣本要求
樣品類型:
細胞或組織，其它樣品信息請詳詢
樣品量:
a）細胞：5×10⁸
b）組織：500 mg
樣品運輸與保存:
樣品運輸：樣品置于1.5mL Eppendorf管中，封口膜封好，干冰運輸。
樣品保存：細胞樣品或新鮮組織塊液氮凍存后-80℃保存。

案例解析
案例 1. RNA pull down檢測lncRNA與蛋白質相互作用 
近年來，大量的研究表明長鏈非編碼RNA（LncRNA）與多種cancer的發生息息相關，這篇文章中作者研究了在非小細胞肺ai（NSCLCs）中起重要調控作用的lncRNA-linc00630。作者通過RNA pull down等實驗發現，linc00630主要通過結合組蛋白去乙?；窱（HDAC1）以及DEAD-box解旋酶23（DDX23）來發揮其功能機制。

圖1. 長鏈非編碼RNA-Linc00630表達驗證及功能表征

案例2. RNA pull down檢測circRNA與蛋白質相互作用
環狀RNA是近年來受到關注一類非編碼RNA，目前主要認為環狀RNA通過miRNA海綿機制調控基因表達，但是對于其更全 面的分子功能知之甚少。這篇文章中作者發現在不同cancer細胞中circ-Foxo3持續少量表達，而在cancer細胞凋亡的過程中，circ-Foxo3表達量明顯增加。circ-Foxo3可以促進MDM2介導p53進入素化途徑降解，使p53含量下降，同時circ-Foxo3又可以通過阻止MDM2介導Foxo3泛素化而提高Foxo3的表達量。

圖2. circ-Foxo3cancer細胞中表達情況