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技術簡介
蛋白免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation,CoIP)是以抗體和抗原之間的專一性作用為基礎,研究蛋白-蛋白間相互作用的經典方法。蛋白免疫共沉淀的設計理念是,假設一種已知蛋白是某個大的蛋白復合物的組成成員,那么利用這種蛋白的特異性抗體,就可能將整個蛋白復合物從溶液中“拉”下來,進而可以用于鑒定這個蛋白復合物中的其他成員。通過質譜檢測已知蛋白的未知結合蛋白,通過 Western Blot檢測兩種目標蛋白是否在體內結合。云序生物具有成熟的蛋白質組學平臺,提供CoIP-質譜和CoIP- Western Blot的全套服務。
圖注:云序 CoIP 實驗流程
云序優勢
一站式服務:
客戶只需提供細胞或組織以及抗體,云序生物為您完成樣品處理、IP實驗、蛋白檢測到數據分析整套服務流程。
低豐度富集:
富集檢測低豐度目的蛋白-蛋白復合物
具有成熟蛋白質組學平臺:
提供CoIP-質譜和CoIP-Western Blot。
樣本要求
1)樣品類型:細胞、組織,其它樣品信息請詳詢
2)樣品信息:目標蛋白具體信息以及物種信息
3)樣品量
細胞:5×108
組織:500mg
4)樣品保存:細胞樣品或新鮮組織塊(切成 5-10 mg 小塊),液氮凍存后,-80℃
保存。
5)樣品運輸:干冰運輸。
案例解析
案例一:CoIP尋找已知蛋白的未知結合蛋白(CoIP-質譜)
原文:NbCSPR underlies age-dependent immune responses to bacterial cold shock protein in Nicotiana benthamiana
期刊:Proceedings of the National Academy of Sciences 影響因子:9.58
植物中,病原物相關分子模式(PAMPs)被模式識別受體(PRRs)識別后,會與LRR-RK BRI1相關激酶1(BAK1)相互作用,從而引發植物的免疫應答反應。本文作者使用BAK1作為分子誘餌來尋找細菌冷休克蛋白的csp22肽(一種PAMPs)所需的模式識別受體(PRRs),作者建立了一種方法來識別僅在csp22處理后與BAK1相互作用的蛋白質,經csp22處理后BAK1在yan草中短暫表達,用CoIP-MS方式鑒定與BAK1互作的蛋白,從而識別csp22所需的新的PRRs--NbCSPR。
圖1.尋找BAK1結合的蛋白--NbCSPR
案例二:CoIP探究兩種已知蛋白的互作(CoIP-Western Blot)
原文:A Novel Allosteric Inhibitor of Phosphoglycerate Mutase 1 Suppresses Growth and Metastasis of Non-Small-Cell Lung Cancer
期刊:Cell Metabolism 影響因子:22.42
PGAM1(磷酸甘油酸突變酶1) 是有氧糖酵解過程中重要的酶,參與細胞內生物大分子合成并維持氧化還原穩態,從而促進腫 瘤細胞增殖及轉移。近期研究表明,非小細胞肺ai(NSCLC)患者中PGAM1表達增加且與不良預后明顯相關。本文發現一種新型PGAM1變構抑 制劑HKB99,通過CoIP實驗證實HKB99能抑 制PGAM1和ACTA2的相互作用,從而抑 制非小細胞肺ai的增殖和分化過程,達到抑 制腫 瘤生長的目的。
圖2. HKB99能抑 制PGAM1和ACTA2的相互作用
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