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ac4C tRNA測序
瀏覽器自帶分享功能也很好用哦~ac4C RNA乙?；窃赗NA ac4C修飾酶的作用下，使N4位乙酰胞嘧啶發生乙?；囊环N保守的化學修飾（N4-acetylcytidine）。早期研究發現該修飾存在于真核生物中絲氨酸及亮氨酸tRNA和18S rRNA上，導致Watson-Crick堿基熱穩定性增加，調控蛋白合成中的編碼準確性；近期研究發現ac4C分布在人類轉錄組中，大多數位點出現在編碼序列（CDS）內，并且通過改善的mRNA穩定性和翻譯促進靶基因表達。
ac4C tRNA測序
ac4C RNA乙?；窃赗NA ac4C修飾酶的作用下，使N4位乙酰胞嘧啶發生乙?；囊环N保守的化學修飾（N4-acetylcytidine）。早期研究發現該修飾存在于真核生物中絲氨酸及亮氨酸tRNA和18S rRNA上，導致Watson-Crick堿基熱穩定性增加，調控蛋白合成中的編碼準確性；近期研究發現ac4C分布在人類轉錄組中，大多數位點出現在編碼序列（CDS）內，并且通過改善的mRNA穩定性和翻譯促進靶基因表達。
技術簡介
ac4C RNA乙?；窃赗NA ac4C修飾酶的作用下，使N4位乙酰胞嘧啶發生乙?；囊环N保守的化學修飾（N4-acetylcytidine）。早期研究發現該修飾存在于真核生物中絲氨酸及亮氨酸tRNA和18S rRNA上，導致Watson-Crick堿基熱穩定性增加，調控蛋白合成中的編碼準確性；近期研究發現ac4C分布在人類轉錄組中，大多數位點出現在編碼序列（CDS）內，并且通過改善的mRNA穩定性和翻譯促進靶基因表達。目前，ac4C RNA乙?；揎椬鳛橐活愋滦蚏NA修飾，是繼m6A修飾之后的又一表觀轉錄組學熱點和“超級潛力股”！
云序生物對ac4C RNA乙?；瘷z測手段為acRIP-Seq技術，技術原理如下： 將乙?；疪NA特異性抗體與被隨機打斷的RNA片段進行共孵育，抓取有乙?；揎椀钠芜M行測序；同時需要平行測序一個對照（Input）樣本，對照樣本只含有打斷的RNA片段，并不添加RNA乙?；禺愋钥贵w與其共孵育。對照樣本用于消除非特異性抓取的乙?；蔚谋尘?。對比免疫共沉淀（IP）樣本和對照樣本（Input）中的序列片段，將RNA乙?；揎椢稽c定位到轉錄組上，并根據RNA-seq數據，計算樣本中RNA乙?；潭燃皩NA表達水平的影響。
云序優勢
一站式服務
客戶只需提供組織、細胞、體液樣品或RNA，云序生物為您完成從ac4C RNA富集，文庫制備，上機測序到數據分析整套服務流程。
抗體富集效率高
云序生物對acRIP-seq實驗每一步驟均設有關鍵質控，全程監控實驗質量，保證客戶得到優 質數據。
專業的生物信息學分析
云序生物擁有專業的生物信息分析團隊，幫助客戶進行實驗數據的全 面挖掘。
RNA乙?；?/strong>測序與轉錄組聯合應用
案例：mRNA中胞嘧啶核苷乙?；龠M其翻譯效率
原文：Acetylation of Cytidine in mRNA Promotes Translation Efficiency
期刊：Cell 影響因子：36.22
美國ai癥研究所（NCI）和弗雷德里克實驗室，發現下調NAT10（RNA乙?；福┠軌蛞?制Hela細胞的行為；并且ac4C是由NTA10催化的mRNA修飾，下調NAT10后，ac4C的總體水平下降；為了進一步探究ac4C的功能，作者對WT和下調NAT10的Hela細胞進行acRIP-seq和mRNA測序，發現ac4C 的peak主要富集在mRNA的CDS區，同時下調NAT10能夠降低ac4C在mRNA中的定點表達，并與靶mRNA的下調有很大關系；作者又進一步發現ac4C乙?；揎椖軌蛲ㄟ^延長mRNA的半衰期并促進mRNA的穩定性，同時也能夠通過ac4C peak中的密碼子偏好性表達，決定并影響mRNA的解碼效率，促進底物翻譯。這些發現不僅擴大了mRNA修飾范圍（包括乙?；瘹埢?，也確立了ac4C在mRNA翻譯調控中的作用。
樣品要求
樣品類型
細胞、組織或RNA，其他樣本類型請電詢。
樣品量
a）細胞：≥2×107
b）組織：500mg - 1g
c) RNA：30μg - 300μg
d) 超微量滿足500ng - 30μg
樣品運輸與保存
樣品運輸：樣品置于1.5mL離心管中，封口膜封好，干冰運輸。
樣品保存：細胞樣品或新鮮組織塊可用TRIZOL或RNA保護劑處理，液氮凍存后-80℃保存；RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中，-80℃保存，避免反復凍融。
ac4C RNA乙?；窃赗NA ac4C修飾酶的作用下，使N4位乙酰胞嘧啶發生乙?；囊环N保守的化學修飾（N4-acetylcytidine）。早期研究發現該修飾存在于真核生物中絲氨酸及亮氨酸tRNA和18S rRNA上，導致Watson-Crick堿基熱穩定性增加，調控蛋白合成中的編碼準確性；近期研究發現ac4C分布在人類轉錄組中，大多數位點出現在編碼序列（CDS）內，并且通過改善的mRNA穩定性和翻譯促進靶基因表達。目前，ac4C RNA乙?；揎椬鳛橐活愋滦蚏NA修飾，是繼m6A修飾之后的又一表觀轉錄組學熱點和“超級潛力股”！
云序生物對ac4C RNA乙?；瘷z測手段為acRIP-Seq技術，技術原理如下： 將乙?；疪NA特異性抗體與被隨機打斷的RNA片段進行共孵育，抓取有乙?；揎椀钠芜M行測序；同時需要平行測序一個對照（Input）樣本，對照樣本只含有打斷的RNA片段，并不添加RNA乙?；禺愋钥贵w與其共孵育。對照樣本用于消除非特異性抓取的乙?；蔚谋尘?。對比免疫共沉淀（IP）樣本和對照樣本（Input）中的序列片段，將RNA乙?；揎椢稽c定位到轉錄組上，并根據RNA-seq數據，計算樣本中RNA乙?；潭燃皩NA表達水平的影響。
云序優勢
一站式服務
客戶只需提供組織、細胞、體液樣品或RNA，云序生物為您完成從ac4C RNA富集，文庫制備，上機測序到數據分析整套服務流程。
抗體富集效率高
acRIP-seq的富集效率是決定數據質量的關鍵，云序生物acRIP-seq實驗采用預驗證的商業化抗體和精心優化的實驗流程，具有極高的效率和特異性。
分子全覆蓋
可全 面檢測mRNA、circRNA、LncRNA、pri-miRNA、rRNA、tRNA等多類RNA分子ac4C乙?；稽c。
云序生物對acRIP-seq實驗每一步驟均設有關鍵質控，全程監控實驗質量，保證客戶得到優 質數據。
專業的生物信息學分析
云序生物擁有專業的生物信息分析團隊，幫助客戶進行實驗數據的全 面挖掘。
RNA乙?；?/strong>測序與轉錄組聯合應用
可整合RNA乙?；瘮祿娃D錄組數據進行生物信息學關聯分析，揭示RNA乙?；瘜虮磉_調控的影響，深入挖掘RNA乙?；墓δ?。
案例解析案例：mRNA中胞嘧啶核苷乙?；龠M其翻譯效率
原文：Acetylation of Cytidine in mRNA Promotes Translation Efficiency
期刊：Cell 影響因子：36.22
美國ai癥研究所（NCI）和弗雷德里克實驗室，發現下調NAT10（RNA乙?；福┠軌蛞?制Hela細胞的行為；并且ac4C是由NTA10催化的mRNA修飾，下調NAT10后，ac4C的總體水平下降；為了進一步探究ac4C的功能，作者對WT和下調NAT10的Hela細胞進行acRIP-seq和mRNA測序，發現ac4C 的peak主要富集在mRNA的CDS區，同時下調NAT10能夠降低ac4C在mRNA中的定點表達，并與靶mRNA的下調有很大關系；作者又進一步發現ac4C乙?；揎椖軌蛲ㄟ^延長mRNA的半衰期并促進mRNA的穩定性，同時也能夠通過ac4C peak中的密碼子偏好性表達，決定并影響mRNA的解碼效率，促進底物翻譯。這些發現不僅擴大了mRNA修飾范圍（包括乙?；瘹埢?，也確立了ac4C在mRNA翻譯調控中的作用。
圖注：ac4C的結構及Ac4C peak在mRNA中的特征分布情況
圖注：ac4C延長mRNA的半衰期，提高其穩定性
圖注：ac4C促進mRNA的翻譯效率
樣品要求
樣品類型
細胞、組織或RNA，其他樣本類型請電詢。
樣品量
a）細胞：≥2×107
b）組織：500mg - 1g
c) RNA：30μg - 300μg
d) 超微量滿足500ng - 30μg
樣品運輸與保存
樣品運輸：樣品置于1.5mL離心管中，封口膜封好，干冰運輸。
樣品保存：細胞樣品或新鮮組織塊可用TRIZOL或RNA保護劑處理，液氮凍存后-80℃保存；RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中，-80℃保存，避免反復凍融。
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